Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttc17E9PVB5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttc17E9PVB5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms