Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc175E9PVB3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms