Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Soga1E1U8D0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga1E1U8D0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms