Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc170D3YXL0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms