Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc13D3YV10 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc13D3YV10 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms