Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700015F17RikD3YUK8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms