Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna7C0LLJ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna7C0LLJ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms