Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r180B9EK86 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r180B9EK86 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms