Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf11bB4XVQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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