Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf11cB4XVP9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms