Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnldc1B2RXZ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms