Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26c1B2RXA7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26c1B2RXA7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms