Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cspp1B2RX88 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms