Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc8B2RUS7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abcc8B2RUS7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Abcc8B2RUS7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms