Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprbB2RU80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms