Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms