Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apol7aB2RT54 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apol7aB2RT54 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms