Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc2B2RR83 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ythdc2B2RR83 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms