Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf3B2RQG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf3B2RQG2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms