Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms