Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr2B1AVP0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms