Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms