Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms