Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4A4UUI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms