Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Palm3A2TJV2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms