Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms