Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf2A2AT37 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms