Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Patl2A2ARM1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Patl2A2ARM1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms