Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga8A2ARA8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga8A2ARA8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms