Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtf1A2AQ19 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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