Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubb1A2AQ07 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tubb1A2AQ07 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb1A2AQ07 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms