Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll9A2APC3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttll9A2APC3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms