Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SetxA2AKX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms