Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin3aA2AIR5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin3aA2AIR5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms