Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ambra1A2AH22 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ambra1A2AH22 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms