Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup62clA2AG10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nup62clA2AG10 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms