Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930447F04RikA2AFR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930447F04RikA2AFR2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms