Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms