Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbbp8nlA2ABX0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms