Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprfA2A8L5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprfA2A8L5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms