Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm2A2A7B5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm2A2A7B5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms