Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpatch8A2A6A1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpatch8A2A6A1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpatch8A2A6A1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms