Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A286YDU1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A286YDU1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms