Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd3A0A140LIW3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmpd3A0A140LIW3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms