Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921501E09RikA0A0R4J054 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms