Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms