Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms