Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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