Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44576-201ENSMUST00000208876 411 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tomm40l-201ENSMUST00000005817 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms