Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms